Die 'unknome' Kataloge enthalten fast 2 Millionen Proteine. Viele davon bleiben mysteriös.

Wenn es um weite, unerforschte Grenzen geht, denken wir an den Weltraum und die Ozeane der Erde. Aber auch im menschlichen Körper gibt es noch viel zu entdecken. Lernen Sie das "Unknome" kennen, eine neue Datenbank, die betont, wie wenig wir immer noch über menschliche Gene und Proteine wissen.

Die öffentlich zugängliche Datenbank ordnet Proteingruppen nach dem Grad des Unbekannten ein. Diese Informationen könnten Wissenschaftlern helfen, Proteine für zukünftige Studien zu identifizieren, einschließlich der Behandlung von Krankheiten und der Arzneimittelentwicklung, berichten Forscher am 8. August in PLOS Biology.

Zellbiologe Sean Munro und seine Kollegen haben das Unknome - ein Kofferwort aus "unknown" (unbekannt) und "genome" (Genom) - erstellt, um wenig untersuchte, aber potenziell wichtige Proteine und ihre entsprechenden protein-kodierenden Gene zu identifizieren: DNA, die das Rezept eines Proteins in RNA kopiert (SN: 2/9/22).

Proteine werden üblicherweise in Familien gruppiert, die einen gemeinsamen evolutionären Vorfahren haben. Die Unknome-Datenbank enthält alle Protein-Familien, bei denen mindestens ein Protein nach den genetischen Anweisungen im menschlichen Genom oder in den Genomen von 11 anderen häufig untersuchten Organismen kodiert wird. Über 13.000 Gruppen und fast 2 Millionen Proteine sind enthalten.

Das Unknome weist jeder Gruppe von Proteinen einen "Bekanntheitsscore" zu, der sich danach richtet, wie viel über ihre entsprechenden Gene bekannt ist. Von diesen Gruppen haben etwa 3.000, darunter 805 mit mindestens einem menschlichen Protein, einen Bekanntheitsscore von null, was zeigt, dass im menschlichen Genom noch viel zu lernen ist (SN: 3/31/22).

Munro und seine Kollegen verwendeten die Datenbank, um 260 Gene zu untersuchen, die sowohl bei Fruchtfliegen als auch beim Menschen vorkommen und niedrige Bekanntheitsscores aufweisen. Nachdem sie die Aktivität jedes gens, das Proteine kodiert, bei den Fliegen heruntergefahren hatten, stellten die Forscher fest, dass etwa 60 für das Überleben unerlässlich waren. Andere waren wichtig für Fortpflanzung, Wachstum, Bewegung und Resistenz gegen Stress.

"Auch bei gut erforschten Organismen wie Fliegen gibt es immer wieder Neues zu entdecken", sagt Munro vom Labor für Molekularbiologie des Medical Research Council in Cambridge, England.

Ob einige oder alle diese Gene ähnliche Auswirkungen beim Menschen haben, ist noch unbekannt. Aber die Datenbank könnte Forschern helfen, wichtige menschliche Proteine zu identifizieren, indem sie ähnliche Proteine in leichter zu untersuchenden Organismen wie Fruchtfliegen schnell durchsuchen, sagt der Datenscientist Tudor Oprea von Expert Systems Inc., einem Unternehmen für Arzneimittelentwicklung in San Diego, der nicht an der Studie beteiligt war.

Munro sagt, der nächste Schritt für seine Gruppe sei die Zusammenarbeit mit ähnlichen Initiativen wie der Understudied Proteins Initiative für eine groß angelegte Untersuchung dieser mysteriösen Proteine.

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